Každý program v regulátoru CLARE se vytváří z bloků. Pomocí tlačítka (Uprava) můžeme změnit příkaz aktuálně vybraného bloku nebo blok přidat (pokud jsme na bloku s příkazem Konec). Po jeho stisku se zobrazí následující obrazovka pro výběr příkazu:
První tři základní příkazy jsou využity i manuálním režimu. V programovacím režimu je možné navíc je skládat za sebou. Příkaz CasNT je jen jinou formou příkazu Ramp. Příkaz SkokPg lze využít pro prodloužení počtu bloků v programu nebo pro společný konec u více programů. Příkazem Alarm je možné program synchronizovat s reálným časem. Příkaz Vstup umožní počkat na určitý stav na digitálním vstupu regulátoru. Příkazy Vystup, CisAO a Vykon slouží k nastavení výstupů regulátoru v průběhu programu. Příkaz Volno se automaticky přeskakuje a příkaz Konec program ukončí.
Příkazy jsou podrobně popsány v následujících článcích.